Le Programme Archéologique San José de Moro a commencé en 1991 sous la direction de Luis Jaime Castillo (PUCP) et Christopher Donnan (UCLA), et avec la participation de Ulla Holmquist, Marco Rosas, Carlos Wester, Alana Cordy-Collins et Donna McClelland.

Plus tard, en 1995, le PASJM connu sa seconde phase de développement, cette fois ci sous la direction de Luis Jaime Castillo, Carol Mackey et Andrew Nelson. Les fouilles ont été menées dans le secteur de San José de Moro ainsi que dans le secteur de l’Algarrobal de Moro. Durant cette période ont aussi participé Daniel Fernandez, Flora Ugaz, Julio Rucabado, Gabriel Freyre, Juan Pablo Murrugarra, Bill Sapp, Chris Nelson, entre autres étudiants péruviens et étrangers.

A partir de 1998, le PASJM a été dirigé par Luis Jaime Castillo qui, avec différents collaborateurs venant d’universités péruviennes et étrangères réalisèrent les fouilles à San José de Moro mais aussi dans divers sites de la vallée de Jequetepeque. Tout au long de ces années le programme a compté avec la participation de Martin del Carpio, Katiusha Bernuy, Jackelyn Bernuy, Paloma Manrique, Vanesa Bernal, Rocío Delibes, Alfonso Barragán, Rosa Lena, Ángel Guerrero, Cecile Raoulas, Sophie Vallet, Patricia Pérez-Albela, Pedro Fernández, Jesús López, Beatriz Fernandez, Marta Venegas, Ilana Johnson, Colleen Donley, Moisés Tufinio, María Concepción Godoy, Haru Heshiki, Ethan Cole, Kari Zobler, Katie Chiou, Jessica Castro, Daniela Zevallos, David Rodríguez, Enrique Urteaga, Caroline Thiriet, etc.